HILIC柱的固定相是亲水的，并且通常在一定pH范围内是带电荷的。亲水性越强的化合物，被保留的时间越长。和大多数其他液相色谱技术不同的是：HILIC的部分流动相是作为固定相的一部分来起作用的。色谱柱使用一段时间后会发现一些问题，比如柱效下架、分离效率变差等。当你发现HILIC柱出现分离效率变差、保留时间改变和校准曲线偏离等现象时，很可能色谱柱保留了一些不希望保留的物质，而使柱容量改变了。
如果柱压升高，常常是因为样品基质中的某些组分形成沉淀，堵塞了色谱柱入口的多孔滤片。恒谱生建议使用强缓冲液或盐溶液在低流速下反向冲洗色谱柱来部分恢复柱子的性能。如果是柱效下降，可以考虑是否是死体积太大导致降低柱效。为减小死体积，色谱系统里所有的连接管线应尽可能的短。但是为了将峰加宽减至小，且不降低柱效，用减小系统中连接各部件的所有管线内径来减小死体积的效果是很有限的，这样柱反压会增大，并且会造成意外管线堵塞等。恒谱生PEEK管线具有优异的耐化学能力和生物可兼容性，PEEK管线能够耐受卤化盐类、强缓冲液、强活性的流动相的侵蚀，适用范围广。
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